一种硅油基含碳纳米管纳米流体的制备方法，其特征在于：它由表面功能化并经球磨截断短化的碳纳米管、硅油和分散剂按照体积比0.1％～1.0％：93.6％～98.9％：1％～5.4％组成；制备步骤如下：首先将硅油与分散剂按照所述体积比直接共混，在高剪切乳化条件下，将表面功能化及截断短化处理的碳纳米管分散到硅油与分散剂的混合物中，制得硅油基含碳纳米管纳米流体。所述的分散剂为亲油性非离子表面活性剂，选用六甲基硅氧烷。本发明纳米流体分散均匀、稳定时间长，导热系数高。本发明制备的纳米流体当碳纳米管体积含量为1.0％时纳米流体导热系数比硅油提高达30％。